Ο Ι.Ν. Αγίου Αθανασίου βρίσκεται μέσα σε πευκόδασος, σε ένα από τα πιο όμορφα σημεία του χωριού. Η ανέγερσή του τελειοποιήθηκε τον Απρίλιο του 1904 με δαπάνες των κατοίκων της Δεσφίνας. Είναι μία μεγάλη εκκλησία πάνω από 20 μέτρα μήκος και πλάτος 7,5 μέτρα. Τύπου βασιλικής με τρούλο, η οποία βρίσκεται σε λόφο στην Ν.Δ. πλευρά του χωριού. Ο Ι.Ν. έχει ανακαινισθεί πάνω από μία φορά. Το τέμπλο της, το οποίο είναι μεν χτιστό, αλλά διαθέτει στο επάνω μέρος μία χρυσή ξυλόγλυπτη ταινία μεγάλης τέχνης, απομεινάρι ίσως ενός παλαιού ξυλόγλυπτου τέμπλου. Από αυτό το προϋπάρχουν τέμπλο δημιουργήθηκε επίσης και το προσκυνητάρι στο οποίο είναι τοποθετημένη η εικόνα του τιμώμενου Αγίου Αθανασίου. Η εκκλησία είναι επιμήκης, με δύο εισόδους από το Βορρά και μία από το Νότο, πολλά παράθυρα, ενώ στην Δυτική πλευρά της έχει ενσωματωθεί μία αποθήκη.Στη Βόρεια πλευρά του ναού είναι ενσωματωμένη η κτητορική πέτρινη πλάκα. Το κωδωνοστάσιο είναι πέτρινο και βρίσκεται λίγα μέτρα από την κόγχη του ιερού βήματος. Στον περίβολο του ναού υπάρχουν αρκετά πεύκα ενώ ο προσκυνητής που θ’ ανέβει στον λόφο έχει τη δυνατότητα να απολαύσει μία γενική άποψη της Δεσφίνας. Ο Ι.Ν. πανηγυρίζει στις 18 Ιανουαρίου (μνήμη του Αγίου)